L'attività svolta dall'Ufficio non si configura come mera erogazione di servizi all'utenza; nell'ambito delle Misure attribuite alla competenza regionale, all'Ufficio Sostegno alla Flotta e interventi strutturali competono, infatti, attività di programmazione e di gestione di varie misure afferenti le priorità n. 1 "Promuovere una pesca sostenibile sotto il profilo ambientale, efficiente in termini di risorse, innovativa, competitiva e basata sulle conoscenze",  n. 5 "Favorire la commercializzazione e la trasformazione". Previa istruttoria delle istanze pervenute in esito agli Avvisi pubblici emanati, vengono erogati i contributi in favore di soggetti operanti nel settore ittico abruzzese sia privati, quali le imprese del settore della trasformazione e commercializzazione e le imprese della pesca marittima operanti nei Compartimenti di Pescara e di Ortona, che pubblici, quali le Autorità Portuali, gli Enti locali e le Aziende regionali abruzzesi.